1995年12月，上实集团出资1000万美元合资组建三维制药，标志着上实集团正式进入医药产业。1997年6月，上实集团控股收购国内A股上市公司上海实业联合集团股份有限公司(简称“上实联合”，600607.SH)。通过资产重组，上实联合实现向医药业务的转型。1999年12月，上实控股将旗下正大青春宝等医药资产分拆以上实医药科技（8018.HK）在香港创业板上市。自此，初步形成海内外两个医药业务发展平台。
2003年5月，上实集团决定启动医药产业重组，通过私有化上实医药科技、收购上实联合股权和成立医药事业部,统一医药投资平台。2005年2月，上实集团医药产业板块宣告形成，进而构建了统一的医药投资、经营与管控平台，实行相应的资产与业务整合。2006年11月，上实联合更名为上海实业医药投资股份有限公司(简称“上实医药”)。
为加快上海生物医药产业发展，重振上海医药产业的雄风，2008年6月，上海市委、市政府决定由上实集团控股并重组上海医药集团有限公司（简称“上药集团”）。上海市委、市政府的这一重大战略举措给上实集团医药业务发展带来难得的历史性机遇，上实集团医药业务进入新的发展阶段。在上海市委、市政府的正确领导下，在社会各界关心支持和有关各方共同努力下，上药集团重组工作总体进展顺利。
2009年10月，上药集团重组方案正式公布。本次重组采用换股吸收合并、发行股份购买资产等手段，吸收合并上实医药、上海市医药股份有限公司（600849.SH）和上海市中西药业股份有限公司（简称“中西药业”，600842.SH）三家上市公司，形成上海医药集团股份有限公司（简称“上海医药”，601607.SH），同时将上实集团（含上药集团）73.85亿元医药资产注入上海医药，实现上实集团医药业务的整体上市。
2010年3月，在完成全部法定程序后，重组后的新“上海医药”在上海证券交易所恢复交易，原上实医药和中西药业两家上市公司正式退市，上海医药成为上实集团唯一医药业务平台。
2011年5月，上海医药圆满完成H股发行，共募集资金净额154.9亿元港币，上海医药由此成为内地首家“A＋H”大型医药上市公司。截至2016年12月31日，上海医药股权结构见下图。
上海医药是上实集团医药业务的唯一载体。上海医药是一家总部位于上海的全国性医药产业集团，主营业务覆盖医药研发与制造、分销与零售，2022年营业收入2320亿元，公司综合排名位居全国前列，是中国为数不多的在医药产品和分销市场方面均居领先地位的医药上市公司，入选上证180指数、沪深300指数样本股，H股入选恒生指数成分股、摩根斯坦利中国指数（MSCI）。
上海医药研发以创新为长期坚持的方向，致力于为重大疾病和慢性病提供安全有效的治疗药物。2022年研发总投入28亿元，占工业销售收入的10.47%。公司建立了以中央研究院为技术核心的多层次研发体系，拥有1个国家级企业技术中心以及10个省市级企业技术中心，累计拥有发明专利319件，公司合作完成的两个项目分获2014、2015年国家科技进步一等奖。公司采用开放式研究模式，与中国科学院、中国药科大学、沈阳药科大学、日本田边三菱制药、第二军医大学、上海复旦张江生物医药等机构建立紧密合作关系，多个创新药物处于申报临床或临床研究阶段。
上海医药制造覆盖化学和生物药品、现代中药和保健品、医疗器械等领域，产品聚焦心脑血管类、全身抗感染类、消化系统、免疫代谢类、神经精神类、抗肿瘤类等治疗领域，生产片剂、胶囊、粉针（含冻干）、小容量注射液、滴眼剂、气雾剂、凝胶剂等20余种剂型，过亿产品26个。公司旗下拥有信谊、雷氏、龙虎、苍松、国风、神象、鼎炉等多个品牌为中国驰名商标，并被授权使用中国驰名商标青春宝、胡庆余堂。公司所有药品生产企业全部通过新版GMP认证，并全面实施精益六西格玛管理，积极推进两化融合；有多个原料药或制剂通过了WHO、FDA、欧盟以及其他发达国家的质量认证。
上海医药的分销网络以中国经济最发达的华东、华北、华南三大重点区域为中心辐射全国各地，公司分销业务规模排名全国前三。公司分销服务以医院纯销为主，覆盖各类医疗机构超过2万5千家，并与全球众多跨国药企开展合作，致力于打造高效、敏捷、智慧的供应链管理体系，提供以供应链延伸服务和临床支持服务为核心的医院现代服务解决方案，积极参与医院药房托管及合办药房。公司的疫苗、高端耗材、DTP（高值药品直送）及SPD（医药物流管理技术）等新业务发展在国内处于领先地位。公司积极发展医药电商业务，上药云健康与京东、万达、丁香园等开展战略合作，致力于为患者提供专业、安全、便捷的处方药购买和全面的长期健康管理服务。
上海医药药品零售销售规模居全国药品零售行业前列，上海华氏大药房拥有药房的数量在华东地区名列前茅。零售业务覆盖全国16个省、直辖市及自治区，总数近1800家。上海医药的零售业务包括连锁药店、合办药房、DTP 药房等多种业态，并以现代信息技术为载体，拓展天猫旗舰店、远程视频药学咨询、医药零售网、自助购药机等新的健康服务模式。
公司倡导“创新、诚信、合作、包容、责任”的企业核心价值观，致力于持之以恒，提升民众的健康生活品质，努力打造受人尊敬、拥有行业美誉度的领先品牌药制造商和健康领域服务商。
上海医药核心企业共有11家。
1、上药控股有限公司
简介：上药控股有限公司是中国排名第二的大型医药分销企业，分销网络覆盖华东、华北、华南等中国经济最发达地区，与世界前20位跨国公司以及国内外重要企业和医院客户建立密切的业务关系，拥有现代医药物流支持和高品质的增值服务能力。
2、上药科园信海医药有限公司
简介：上药科园信海医药有限公司是中国领先的高端药品、疫苗和耗材等业务的大型医药供应链服务提供商，是众多世界制药巨头在中国市场的重要商业合作伙伴。
3、上海信谊药厂有限公司
简介：上海信谊药厂有限公司是中国领先的品牌化学制药骨干企业，其消化代谢、心血管等治疗领域的产品在国内具有竞争优势，微生态、生化制剂在全国居领先地位，拥有粉针剂、气雾剂、眼药水、软胶囊、缓控释制剂五大特色剂型。
4、上海第一生化药业有限公司
简介：上海第一生化药业有限公司是中国生物、生化制剂的核心企业，拥有生物提取、纯化、中草药提取以及原料药制剂一体化生产的核心技术，按照欧盟标准设计、符合CGMP要求的现代冻干粉针车间居国内生化制剂领域领先水平。
5、上海新亚药业有限公司
简介：上海新亚药业有限公司是中国最早生产抗生素的企业，也是目前国内品种齐全、规格丰富、特色鲜明的抗生素专业制造企业，拥有强大的抗感染药物研发能力和系列化的专利技术储备。
6、上海市药材有限公司
简介：上海市药材有限公司是中国大型现代中药企业，主营中药材、中药饮片，中成药及中药保健品。旗下“雷氏”、“神象”商标为中国驰名商标，产品“上海六神丸”入选国家级非物质文化遗产名录。
7、杭州正大青春宝药业有限公司
简介：正大青春宝药业有限公司是国内中药现代化领军企业，生产中药注射剂、片剂、颗粒剂、胶囊等八种剂型近百种产品，旗下"青春宝"商标为中国驰名商标，青春宝抗衰老片、参麦注射液是浙江省名牌产品。
8、常州药业股份有限公司
简介：常州药业股份有限公司是中国心脑血管药物特色原料和制剂一体化的专业工厂，旗下的“常药”商标为江苏省著名商标，复方利血平片、卡托普利、依那普利、复方硫酸双肼屈嗪、阿米三嗪等品种为国内首家研制。
9、上海中西三维药业有限公司
简介：上海中西三维药业有限公司是由上海中西药业股份有限公司和上海三维制药有限公司组建而成的特色原料药和配套制剂制造企业，在抗风湿、精神神经和抗糖尿病领域拥有具有竞争力的产品系列和领先的市场占有率。
10、青岛国风药业股份有限公司
简介：青岛国风药业股份有限公司是现代特色中成药骨干企业，主营中成药、海洋药物及生物制剂，旗下“国风”品牌为中国驰名商标，拥有全国唯一的海洋药物科学研究所。
11、上海医药集团股份有限公司中央研究院
简介：上海医药集团股份有限公司中央研究院是上海医药药物研发的核心机构，致力于具有自主知识产权的创新药物和品牌仿制药的研发，通过自主研发、合作研发，参与国家新药重大创制专项等，形成多个药物研发及产业化平台，为企业发展提供强大的技术支持。
中国驰名商标
| 中药 |
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|---|---|
| 化学药 |  |
著名商标
| 中药 |
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| 化学药 |  |
| 商业零售 |  |
| 医疗器械 |
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 名称：培菲康 |
 名称：丹参酮IIA磺酸钠注射液 |
 名称：珍菊降压片 |
 名称：银杏颗粒 |
 名称：养心氏片 |
 名称：中华清凉系列 |
 名称：丹香冠心注射液 |
 名称：硫酸羟氯喹片 |
 名称：卡托普利系列（制剂+原料） |
 名称：参麦注射液 |
 名称：丹参注射液 |
 名称：抗衰老片 |
 名称：注射用头孢曲松钠 |
 名称：注射用头孢噻肟钠 |
 名称：胃复春片 |
 名称：新癀片 |
 名称：乳癖消片/胶囊 |
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